Archivos diarios: noviembre 22, 2017

Gabedit : química computacional

Gabedit es una interfaz gráfica escrita en C y GTK+, para paquetes de química computacional. Una rama de la química que desarrolla modelos matemáticos y programas de ordenador, capaces de calcular estructuras y propiedades de los sistemas moleculares, así como realizar diferentes tipo de simulaciones.

 Una interfaz única que nos muestra los resultados de programas como Firefly (antesPCGamess), GAMESS, Gaussian, MOLCAS, MOLPRO, MPQC, OpenMoac, Q-Chem, entre otros que veréis en el panel izquierdo de la aplicación.

Gabenit incluye herramientas para editar, convertir y procesar los datos, siendo compatible con los mayoría de formatos de archivo molecular, utilizados en la química cuántica.

Entre las características de Gabenit está la representación en modo 3D o con diagramas de contorno, de las órbitas moleculares o la densidad de electrones. También la generación dearchivos POV-Ray para geometría, superficies y contornos.

La exhibición de espectroscopia Raman, UV-Vis e infrarroja, son otras de las posibilidades que nos ofrece este software.

Destacar su generador de moléculas (Molecule Builder) que nos permite dibujar rápidamente una molécula y examinarla en tres dimensiones. Moléculas que se pueden construir por átomo, compuesto cíclico (anillo), grupo, aminoácido y nucleósido.

Además podemos exportar los resultados a una amplia variedad de formatos (BMP, JPEG, PNG, PPM, PDF, EPS, PS) incluyendo animaciones, para una adecuada visualización de los mismos.

Gabedit se distribuye bajo licencia libre, estando disponible para Linux, Mac OS x y Windows.

Instalación en GNU/LINUX

En openSUSE Tumbleweed y Leap lo podemos instalar desde su página web mediante 1-click.

En Debian y derivadas como Ubuntu, lo podemos instalar mediante:

sudo apt install gabedit

Para Arch Linux y derivadas (Antergos, Manjaro) está disponible en AUR y lo podemos instalar desde linea de comandos con:

pacaur -S gabedit
En Fedora:
su -c
dnf install gabedit

Una vez instalado el paquete es cuestión de dejarse llevar por el asistente, que nos permite personalizar el programa en asuntos como los colores o las fuentes tipográficas.

En el página web del creador de Gabedit encontraréis abundante información y varios ejemplos de uso del programa.

Fuente

Kernel 4.14.1 Disponible

Después de la reciente salida del Kernel 4.14, por fin ha llegado su primera revisión y, por lo tanto, su primera versión considerada estable al 100%. La versión 4.14.1 ya está disponible para su descarga e instalación, algo que muchos estabais esperando.

La serie de Kernel 4.14.x ha sido muy esperada por todos, ya que, es el primer Kernel de Linux en poseer elsoporte de 6 años, algo que ya adelantamos aquí hace un par de meses. De esta forma, estamos ante la versión más estable y segura del Kernel hasta la fecha, apta para instalar y “despreocuparse “, durante 6 años.

La versión 4.14.1, se considera la primera versión estable de la serie 4.14. x. Esto se debe a la política de seguridad de los kernel, los cuales dejan la primera versión (en este caso la 4.14), como inestable. Esto se debe a que algunas veces, se pueden colar pequeños fallos de seguridad por cumplir los plazos y entonces, se recomienda no instalar la primera versión de la serie en entornos de desarrollo por seguridad.

Sin embargo, la versión .1, en este caso la 4.14.1, ya se considera totalmente estable. Esto nos permitirá disfrutar de este Kernel, que además de incluir un soporte de larga duración, también mejora la seguridad de cifrado de memoria de AMD, mejora en la gestión de memoria de tarjetas gráficas y un aumento del límite de memoria en los procesadores con arquitectura x86.

Además, se ha mejorado la capacidad de compresión en los sistema Btrfs y SquashFS, usando el sistema zstd. Además, se han introducido otras pequeñas mejoras, se han actualizado los drivers y se han corregido los bugs detectados en versiones anteriores. La versión 4.14.1, apenas ha cambiado con respecto a la 4.14, pero su salida ha servido para garantizar la estabilidad de esta versión.

La versión 4.14.1, irá añadiéndose a los repositorios de varias distribuciones, en especial las Rolling Release. Sin embargo, podemos descargarlo como siempre en Kernel.org y compilarlo de forma manual en nuestra distribución favorita.

Fuente

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